В конце двадцать первого века человечество достаточно освоило космос, чтобы путешествия по галактике не казались бы необычным делом. Второклассницу Алису Селезневу, отец, ученый-биолог, берет в дальнюю экспедицию. С Селезневыми на "Пегасе" отправляются для сбора редких инопланетных животных капитан корабля Геннадий Полосков, бортмеханик Зеленый.
На планете Трех Капитанов членов экспедиции встречает смотритель строящегося музея космоса доктор Верховцев. Вначале он много рассказывал о будущем музее, своей планете, но когда его прямо спросили о капитанах, Верховцев замкнулся и отказался говорить. Он успел рассказать про странные кустики со спутника Альдебарана и про Пустую планету, но странное поведение доктора удручало.
На Пустой планете Селезнев и товарищи разгадали тайну преображения живых существ. На планете Блук надеялись посетить еженедельный базар, где продавались редкие виды животных. Разбежались купленные невидимые рыбы, приобрели шапку невидимку и животное-индикатор, решили искать птицу-говоруна. Один из ушанов тайком продал Селезневу говоруна. За ним охотился непонятный толстый человек, который пробовал даже угрожать, но потом испугался полиции.
Полозков направлял корабль корабль на помощь Второму капитану к планете Медуза, но пришлось завернуть на планету Шелезяка, чтобы спасти ее металлических жителей от гибели. Им подсыпал в масло алмазную пыль человек, похожий на Верховцева. На третьей планете системы Медуза с помощью Говоруна и зеркальных цветов продолжили поиск Капитана. Внезапно нагрянувшие пираты во главе с толстым Весельчаком У и профессором Верховцевым захватили экипаж, но Алиса и Говорун исчезли.
Алиса после побега из подземелья, которое исследовали пегасовцы, сумела привести помощь, настоящего Верховцева и Первого капитана. Арестовав злодеев, друзья нашли в бункере множество награбленного и спасли умирающего фиксианца, Третьего капитана. Члены экипажа "Пегаса" набрали много интересных животных и приобрели новых, надежных друзей.
