Первое и самое верное наблюдение, которое приходит в голову дворняге Шарику, обнюхивающему шубу Филиппа Филипповича – «нет, здесь пролетарием не пахнет…». Преображенский – настоящий аристократ, живое воплощение уходящей русской интеллигенции. Душевный в обращении с прислугой, уважительный в отношениях с людьми в целом, доктор и с животными придерживается тактики ненасилия. На вопрос своего ассистента о том, как же профессору удалось приманить такого нервного пса, профессор отвечает: «Лаской-с…террором ничего поделать нельзя» и говоря уже не о собаке, он добавляет: «Они напрасно думают, что террор им поможет…». Булгаков любуется культурой быта своего героя. Его квартира выглядит островком стабильности в том хаосе, который творится за стенами дома.
Но у этого благополучия есть иная сторона. Профессор обеспечивает «вечную молодость» проворовавшимся чиновникам. Несмотря на высокую нравственность, профессор получает деньги от паразитов на теле общества. Жалкого пса он подбирает на улице не от того, что его жалко, а для того, чтобы поставить на собаке эксперимент. Профессор не чувствует никакой ответственности за «того, кого приручил». Филипп Филиппович оправдывается благородными целями, говорит о развитии евгеники и заботе о судьбах человечества. Но вопрос того, насколько морально превратить милейшего пса в уродливейшее существо, так и зависает в воздухе.
В новом существе, появившемся на свет в ходе эксперимента, органично соединились задатки вечно голодного пса Шарика и люмпена Клима Чугункина с идеологией домкома Швондера. Появившийся на свет Полиграф Полиграфович Шариков заставляет профессора испытать целую гамму эмоций от раздражения до раскаяния в содеянном. Пролетарский вариант Франкенштейна полностью выходит из-под контроля своего создателя. Автор показывает тяжелейшие последствия, вызванные вторжением человека в естественный ход развития. Не только Шарикова необходимо вернуть в его естественное состояние, вся послереволюционная Россия, по мнению Булгакова, должна вернуться на естественный путь развития.
Некоторые исследователи полагают, что прообразом профессора Преображенского был физиолог Павлов. Примечательна история, случившаяся с профессором в реальной жизни. Однажды Иван Петрович встретил коллегу-ученого, который умирал от голода. Ученый попросился на роль «подопытного пса» за еду. Павлов не мог оскорбить коллегу, просто дав ему денег. Он согласился, дал коллеге денег и велел отъесться перед началом экспериментов. Так продолжалось несколько раз, пока ученый не нашел настоящую работу.